Un jeu plus compliqué qu'il n'en a l'air, car les pikmins sont, (comme la plupart d'entre nous) mortels !
Il faut contrôler des dizaines de pikmins en même temps (jusqu'a 9999 pikmins dispos dans l'oignon (maison des pikmins), et 100 avec vous) et les scinder en groupes, pour retrouver le plus vite possible les 30 pieces du vaisseau. Tout repose sur la gestion des pikmins.